Durante este semestre estaré optimizando el protocolo de Box pcr para poder comparar los resultados que obtenga con los análisis filogenéticos de las secuencias de los genes casssette, con los de la gel del box pcr. Esto me ayudara a hacer mejor análisis de los resultados que obtenga en mi investigación. También estaré construyendo arboles filogenéticos de las secuencias parciales de los genes cassette para analizar la relación evolutiva de estos en comparación con otras bacterias que poseen el mismo fragmento de DNA. Esto me ayuda a identificar qué tipo de genes de resistencia a antibióticos están codificados en los genes cassette de esta bacteria y compararlas con el listado de antibióticos que estas son resistentes según las pruebas realizadas previamente. También durante este semestre estaré analizando el patrón de bases de las diferentes sepas de Klebsiella presente en la gel del box pcr y agruparlas según su semejanza. Esta información la comparare con el origen de estas sepas, de que paciente fue obtenida y que condición padecía. Esta data me ayuda a comprender que personas son más propensas a contraer infecciones mediadas por bacterias resistencia a antibióticos y cuales enfermedades son mediadas por bacterias resistentes a antibióticos.
El trabajo que estaré realizando durante este semestre es una continuación del los trabajos realizados durante los semestres anteriores. En especial estaré optimizando algunas de las técnicas que utilizo en especial el box PCR, ya que este trabajo de investigación lo estaré utilizando para mi maestría, la cual comenzare en agosto. En especial estaré analizando y construyendo arboles filogenéticos de cada una de las secuencias parciales de los genes cassette que aislé de las cepas de las Klebsiellas que estudio.
Durante este semestre estaré utilizando el programa “gel compare” para analizar las geles de los box PRC de cepas de Klebsiella en este podre hacer un estimado de la cantidad de pares de bases que posee cada una de las bandas presentes en la gel.
Mucho exito!!!